В школе реализуются следующие уровни общего образования: начальное общее образование, основное общее образование, среднее общее образование.

Школа осуществляет образовательный процесс в соответствии с уровнями общеобразовательных программ.

Учебный план МОУ СШ № 96 с углубленным изучением отдельных предметов предусматривает:

• 4-летний срок освоения образовательных программ начального общего образования для 1-4 классов, включая базовый и углубленный уровень программ по иностранному языку.
• 5-летний срок освоения образовательных программ основного общего образования для 5-9 классов базового и углубленного уровня.
• 2-летний срок освоения образовательных программ среднего общего образования на основе различных сочетаний базовых, углубленных и профильных предметов для 10-11 классов.